Como exemplos de atlas 3D, obtido a partir da rotulação de um cérebro por especialistas, podemos citar os atlas estereotáxicos Talairach, CerebrA e Mindboggle-101.
O primeiro atlas de Talairach, baseado no trabalho pioneiro de Jean Talairach em neuroanatomia e estereotaxia na década de 1950, foi publicado em 1988 como Co-Planar Stereotaxic Atlas of the Human Brain. O atlas foi construído a partir do cérebro pós-morte de uma mulher francesa de 60 anos, também conhecido como cérebro de Talairach. Esse atlas é amplamente utilizado como uma referência importante na área de neuroimagem e neurocirurgia. Mais tarde, em 1993, foi publicada uma versão revisada chamada Talairach Atlas: a Co-Planar Stereotaxic Atlas of the Human Brain com algumas atualizações e melhorias.
O atlas CerebrA tem como referência para rotulação das estruturas corticais o volume padrão MNI-ICBM152, que por sua vez é uma média dos dados de ressonância magnética de alta resolução de 152 indivíduos entre 18 a 45 anos, de ambos os sexos. Este volume médio é segmentado manualmente em diferentes estruturas cerebrais anatomicamente definidas e o atlas inclui informações detalhadas sobre a localização e a nomenclatura dessas estruturas. Dispondo de um sistema de coordenadas espaciais padronizado, o atlas CerebrA possibilita o mapeamento de um volume cerebral real referenciado às estruturas rotuladas no atlas.
O atlas Mindboggle-101 é baseado em dados de ressonância magnética de 101 indivíduos entre 22 a 35 anos. Cada indivíduo passou por um processo de pré-processamento de dados, que incluiu a segmentação automática por meio do aprendizado de máquina e o registro dos dados em um espaço comum para permitir a comparação interindivíduos. O atlas resultante contém modelos anatômicos 3D detalhados de diferentes partes do cérebro e ferramentas interativas para analisar a neuroanatomia em diferentes níveis de detalhes, tornando-se uma valiosa fonte de informação para estudos da estrutura cerebral normal e das diferenças individuais na anatomia cerebral.
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